七色蝶の森「木のばけもの」に入るとイベントが発生。
モニカから"狩人のクリスタル""粉砕のクリスタル"をそれぞれ2個ずつ、
"風のクリスタル""水竜のクリスタル"をそれぞれ1個もらえる。
更に、装備中の右手武器の合成ポイントが６上がる。
「甲羅ごろごろ」は赤の封印がかかっており、ユリスはここで戦うことはできない。
モニカが戦闘不能になるとゲームオーバーになってしまうので体力には細心の注意を払いたい。
特にガメロンは防御が高い上に大ダメージを与えてくる厄介なモンスターだ。
封印は敵を殲滅すると解除できる。これで次回以降はユリスをここで戦わせることができる。
「怪魚の沼」に到達するとイベント。釣りをしているファブリースに話しかけ、「ぶどう酒」を使う。
"ぶどう酒"を渡すと、お礼に"つり竿"をもらえる。
先に進むとマスターウータンを発見。イベントが発生する。
イベント後、来た道を戻ると沼のところでイベント発生。
エサを"毒リンゴ"にしてこの沼で魚釣りをするとエンペラーマーダンが釣れる。
エンペラーマーダンとの取引で、"ハグハグ"を釣ってくることになる。
近くの沼で適当に釣れば"ハグハグ"が釣れるので、それをエンペラーマーダンに渡そう。
渡すにはエンペラーマーダンの近くで「！」が出たら□を押して、と
ゲートキーを使うときと同じようにすれば良い。
ハグハグを渡すとエンペラーマーダンの写真が撮れなくなるので注意。
エンペラーマーダンにハグハグを渡し、イベントを見たらファブリースのところに戻る。
ファブリースと共に、シャーロットに戻り、イベント。

イベント後、ジオラマとタイムワープが使用可能に。
ジュラクを復活させるため、ジオストーンを手に入れるため、ホーリーを探すために先へ進む。
「怪魚の沼」へ行き、マスターウータンの所に行くとイベント。
第２章が終わるまでにマスターウータンの写真を撮らないと撮れなくなるので注意。

"ジオストーン"を手に入れたらとりあえず外に出る。外に出るとイベント。
アイテムを持ち運びできる最大数が増える。
また、"ゴロゴロ丸太"28個、"意外と丈夫な布"、"ガラスのもと"、
"砂糖きび"、"鉄クズ"、"火のエレメント"、"水のエレメント"20個がもらえる。

「ボクはピクシー」には青の封印がされており、一度敵を殲滅するまでモニカを呼び出すことはできない。
"ジオストーン"を集めつつ、先へ進む。
「伝説の蛇キラースネーク」では、ゲートが２つあるが、片方のゲートはまだ先に進むことができない。
「伝説の蛇キラースネーク」から持ち帰った"ジオストーン"をダウンロードし、
通常移動時の画面に移行すると、イベント。
木にくわしい人を移住させるために、パームブリンクスからグリンを連れてくることになる。

グリンはユリスの家の庭で花の世話をしているので、話しかけよう。
ユリスで話しかけないときちんと反応してくれない。
"聖水"が欲しいと言われるので、教会で買ってくるかダンジョンで手に入れて渡そう。
グリンが仲間になった後から他のサポートメンバーを仲間にすることが可能になる。

家をつくって配置し、ドアを調べると人を移住させることができるので、グリンを移住させる。
移住させると未来に変化が起きる。

未来に行くとジュラクが復活する。とりあえず現代に戻る。
現代に戻ると未来に変化が起きるので再び未来へ。
"ラフレシアの種"を貰い、ラフレシアの花を咲かせることになる。
花を咲かせるには"太陽のしずく"が必要。"太陽のしずく"はヒマーラに頼まないと手に入らない。
"バッジボックス"を貰い、現代へと戻る。
ジオラマでルネを家に住ませ、カルチャーポイントが30を越えると未来に変化が起きる。
未来へ行くとウッディテイラーが開店。ウッディテイラーで"ヒマーラバッジ"を購入。
現代に戻ろうとするとイベントが発生し、モニカが変身できるようになる。

ヒマーラのいるエリアでヒマーラに変身し、ヒマーラに話しかけると"太陽のしずく"がもらえる。

「七色の滝・入口」には白の封印がかかっており、体力とステータス異常の回復ができない。
ただし、武器の修理とライドポッドの燃料補給はできる。また、コインは泉の回復効果でも回復することが可能。

「七色の滝」で池に"ラフレシアの種"を植えると芽が出る。
芽がでたら今度は"太陽のしずく"を使うとラフレシアが咲く。
白い糸に触るとイベントが発生して花の上へ。
花の上でイベント。七色蝶戦へ。
蝶が分裂し、それぞれの蝶を虹色の順番に攻撃するとイベント。

未来のジュラクのところに戻るとイベント。てんびん谷へ向かうことに。
スターブルに話しかけ、選択肢「うん！」を選ぶと列車が出発する。

てんびん谷に入り、近くの家に入るとイベント。
パームブリンクスに戻り、ダック先生（ギンガートン）を連れてくることに。
ダック先生を連れてリンの家に戻るとイベント。
ラオチャオ飯店を復活させるためにステラ渓谷へと向かう。